生态环境与城市建设学院办学历史溯源于1957年福建建筑工程专科学校开设的工业设备安装专业。1958年设立给排水工程专业，1978年设立建筑机械科，1992年成立建筑设备工程系，1999年开设环境工程专业，2002年更名为环境与设备工程系，2013年组建成立生态环境与城市建设学院，2015年开始招收市政工程与暖通和资源循环科学与工程方向硕士研究生，2021年获批资源与环境硕士专业学位授权点并于2023年开始招生。学院历经60余年发展，在建筑机电、工程设备和生态环保领域培养了7500余名各级各类人才，为区域经济建设和社会发展做出了突出贡献。